Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARXQ96QS3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARXQ96QS3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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