Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COG8Q96MW5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms