Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC114Q96M63 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC114Q96M63 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms