Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC74BQ96LY2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms