Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SAMD8Q96LT4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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