Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCC12Q96J65 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms