Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF496Q96IT1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF496Q96IT1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF496Q96IT1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF496Q96IT1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF496Q96IT1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms