Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC97Q96F63 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC97Q96F63 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC97Q96F63 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC97Q96F63 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC97Q96F63 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC97Q96F63 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC97Q96F63 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC97Q96F63 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC97Q96F63 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC97Q96F63 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms