Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms