Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNRQ92752 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNRQ92752 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNRQ92752 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNRQ92752 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNRQ92752 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNRQ92752 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNRQ92752 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNRQ92752 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNRQ92752 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNRQ92752 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNRQ92752 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNRQ92752 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNRQ92752 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNRQ92752 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNRQ92752 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNRQ92752 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TNRQ92752 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNRQ92752 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNRQ92752 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNRQ92752 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNRQ92752 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNRQ92752 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TNRQ92752 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNRQ92752 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNRQ92752 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNRQ92752 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNRQ92752 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNRQ92752 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNRQ92752 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNRQ92752 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNRQ92752 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNRQ92752 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNRQ92752 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNRQ92752 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TNRQ92752 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNRQ92752 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNRQ92752 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNRQ92752 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNRQ92752 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNRQ92752 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNRQ92752 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNRQ92752 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNRQ92752 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNRQ92752 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNRQ92752 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNRQ92752 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNRQ92752 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNRQ92752 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TNRQ92752 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNRQ92752 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNRQ92752 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNRQ92752 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNRQ92752 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNRQ92752 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNRQ92752 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms