Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRUQ92729 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms