Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms