Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PNLDC1Q8NA58 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PNLDC1Q8NA58 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms