Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SAMD12Q8N8I0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms