Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLDN19Q8N6F1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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CLDN19Q8N6F1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLDN19Q8N6F1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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