Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SVBPQ8N300 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SVBPQ8N300 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SVBPQ8N300 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SVBPQ8N300 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms