Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSX7Q7RTT5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms