Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BBS12Q6ZW61 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BBS12Q6ZW61 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms