Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC141Q6ZP82 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC141Q6ZP82 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms