Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP12Q6UXS9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms