Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LRIG3Q6UXM1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms