Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCBE1Q6UXH8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms