Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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