Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
CSAG1Q6PB30 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms