Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM4Q6P4Q7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM4Q6P4Q7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM4Q6P4Q7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM4Q6P4Q7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM4Q6P4Q7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CNNM4Q6P4Q7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CNNM4Q6P4Q7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms