Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LETMD1Q6P1Q0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms