Protein–RNA interactions for Protein: Q6H8Q1

ABLIM2, Actin-binding LIM protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM2Q6H8Q1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ABLIM2Q6H8Q1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms