Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL39P5Q59GN2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms