Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC153Q494R4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms