Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HFEQ30201 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms