Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM187BQ17R55 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM187BQ17R55 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms