Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
PFKFB3Q16875 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PFKFB3Q16875 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms