Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATP6V1FQ16864 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP6V1FQ16864 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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