Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SGCBQ16585 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SGCBQ16585 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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