Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC18A3Q16572 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC18A3Q16572 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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