Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD5Q16401 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD5Q16401 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD5Q16401 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD5Q16401 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD5Q16401 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD5Q16401 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD5Q16401 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD5Q16401 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD5Q16401 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD5Q16401 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD5Q16401 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD5Q16401 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD5Q16401 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMD5Q16401 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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