Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
E2F4Q16254 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F4Q16254 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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