Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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SNCBQ16143 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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SNCBQ16143 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNCBQ16143 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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