Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TLR1Q15399 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TLR1Q15399 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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