Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NECTIN1Q15223 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NECTIN1Q15223 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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