Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NCF4Q15080 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NCF4Q15080 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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