Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HERC3Q15034 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERC3Q15034 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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