Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HERPUD1Q15011 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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