Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCLAFQ15004 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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