Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMCO1Q147U7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms