Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CIRBPQ14011 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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