Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ALCAMQ13740 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ALCAMQ13740 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms