Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MTMR3Q13615 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MTMR3Q13615 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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