Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC1Q13547 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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