Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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BFSP2Q13515 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BFSP2Q13515 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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BFSP2Q13515 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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BFSP2Q13515 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BFSP2Q13515 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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